53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0344 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2875  glutamate--cysteine ligase  71.4 
 
 		 429 aa  650    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.441186  normal  0.177007 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0173  putative glutamate--cysteine ligase  70.4 
 
 		 431 aa  635    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.466672 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1403  glutamate--cysteine ligase  71.63 
 
 		 429 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0189  glutamate--cysteine ligase  71.63 
 
 		 429 aa  649    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0470  glutamate--cysteine ligase  71.86 
 
 		 429 aa  652    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211009  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0489  glutamate--cysteine ligase  71.86 
 
 		 429 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8441  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2830  glutamate--cysteine ligase  71.63 
 
 		 429 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.759245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2864  glutamate--cysteine ligase  71.4 
 
 		 429 aa  650    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00201852  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2919  glutamate--cysteine ligase  71.4 
 
 		 429 aa  651    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.192205  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2250  glutamate--cysteine ligase GshA  71.4 
 
 		 429 aa  650    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0242  glutamate--cysteine ligase GshA  89.56 
 
 		 431 aa  781    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4188  putative glutamate-cysteine ligase  74.88 
 
 		 429 aa  685    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1955  glutamate--cysteine ligase  80.61 
 
 		 432 aa  726    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0439  glutamate--cysteine ligase  71.4 
 
 		 429 aa  650    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0409  glutamate--cysteine ligase  71.63 
 
 		 429 aa  649    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1660  glutamate--cysteine ligase  79.91 
 
 		 432 aa  709    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.851286 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2781  glutamate--cysteine ligase  71.4 
 
 		 429 aa  651    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.147429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6193  glutamate--cysteine ligase GshA  71.4 
 
 		 429 aa  652    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0654  glutamate--cysteine ligase  71.86 
 
 		 429 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0258  glutamate--cysteine ligase  73.72 
 
 		 429 aa  676    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0527  glutamate/cysteine ligase  74.65 
 
 		 429 aa  686    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0293  glutamate--cysteine ligase GshA  89.56 
 
 		 431 aa  813    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0200  glutamate/cysteine ligase  96.06 
 
 		 431 aa  837    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.770755  normal  0.19114 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0219  glutamate/cysteine ligase  96.29 
 
 		 431 aa  839    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000276666 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3215  hypothetical protein  71.63 
 
 		 429 aa  649    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0344  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  889    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4583  glutamate--cysteine ligase GshA  68.76 
 
 		 431 aa  624  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3940  glutamate--cysteine ligase  68.3 
 
 		 431 aa  619  1e-176  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3910  glutamate--cysteine ligase  68.93 
 
 		 431 aa  619  1e-176  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.195773  normal  0.80234 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3259  glutamate/cysteine ligase  68.93 
 
 		 431 aa  619  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0191292  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0011  glutamate--cysteine ligase GshA  68.46 
 
 		 428 aa  612  9.999999999999999e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0602184 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3750  glutamate--cysteine ligase  67.6 
 
 		 431 aa  610  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.832044 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4542  glutamate--cysteine ligase  67.06 
 
 		 431 aa  610  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.907644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5997  glutamate--cysteine ligase  67.6 
 
 		 431 aa  605  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0724112  hitchhiker  0.00190947 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2408  glutamate--cysteine ligase GshA  66.82 
 
 		 426 aa  598  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2516  glutamate--cysteine ligase GshA  65.43 
 
 		 431 aa  596  1e-169  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0573  glutamate/cysteine ligase  64.72 
 
 		 437 aa  586  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0216  glutamate--cysteine ligase GshA  64.08 
 
 		 431 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0426  glutamate/cysteine ligase  62.44 
 
 		 436 aa  555  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.553194  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0763  glutamate--cysteine ligase GshA  61.92 
 
 		 431 aa  553  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1252  glutamate--cysteine ligase  62.24 
 
 		 429 aa  541  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1824  glutamate--cysteine ligase GshA  56.1 
 
 		 436 aa  479  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3064  glutamate--cysteine ligase  53.55 
 
 		 436 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0913039  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2671  glutamate/cysteine ligase  53.55 
 
 		 436 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.630756  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1811  hypothetical protein  54.63 
 
 		 431 aa  431  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1812  hypothetical protein  54.03 
 
 		 431 aa  429  1e-119  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0513  glutamate/cysteine ligase  51.08 
 
 		 449 aa  429  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2076  glutamate--cysteine ligase  51.31 
 
 		 435 aa  431  1e-119  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000044914  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0105  glutamate--cysteine ligase  51.07 
 
 		 435 aa  430  1e-119  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.005063  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1188  glutamate--cysteine ligase-related protein  33.5 
 
 		 386 aa  239  9e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0125  glutamate--cysteine ligase  33.92 
 
 		 410 aa  237  4e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0076  glutamate-cysteine ligase-related protein  36.03 
 
 		 408 aa  227  3e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0308  glutamate--cysteine ligase  34.81 
 
 		 391 aa  205  1e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>