53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0293 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0344  hypothetical protein  89.56 
 
 
431 aa  787    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1403  glutamate--cysteine ligase  73.49 
 
 
429 aa  662    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0173  putative glutamate--cysteine ligase  71.56 
 
 
431 aa  642    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.466672 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0470  glutamate--cysteine ligase  73.72 
 
 
429 aa  665    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211009  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0189  glutamate--cysteine ligase  73.49 
 
 
429 aa  662    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0489  glutamate--cysteine ligase  73.72 
 
 
429 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8441  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2830  glutamate--cysteine ligase  73.49 
 
 
429 aa  662    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.759245  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1955  glutamate--cysteine ligase  82.71 
 
 
432 aa  733    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2864  glutamate--cysteine ligase  73.72 
 
 
429 aa  666    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00201852  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2919  glutamate--cysteine ligase  73.72 
 
 
429 aa  667    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.192205  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2250  glutamate--cysteine ligase GshA  73.72 
 
 
429 aa  666    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0242  glutamate--cysteine ligase GshA  97.45 
 
 
431 aa  835    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4188  putative glutamate-cysteine ligase  76.74 
 
 
429 aa  702    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4583  glutamate--cysteine ligase GshA  70.63 
 
 
431 aa  634    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0439  glutamate--cysteine ligase  73.72 
 
 
429 aa  667    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2875  glutamate--cysteine ligase  73.72 
 
 
429 aa  666    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.441186  normal  0.177007 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1660  glutamate--cysteine ligase  82.01 
 
 
432 aa  717    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.851286 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0409  glutamate--cysteine ligase  73.49 
 
 
429 aa  664    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2781  glutamate--cysteine ligase  73.72 
 
 
429 aa  667    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.147429  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0258  glutamate--cysteine ligase  75.12 
 
 
429 aa  691    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6193  glutamate--cysteine ligase GshA  73.72 
 
 
429 aa  667    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0654  glutamate--cysteine ligase  73.72 
 
 
429 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0527  glutamate/cysteine ligase  76.51 
 
 
429 aa  702    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0200  glutamate/cysteine ligase  89.79 
 
 
431 aa  789    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.770755  normal  0.19114 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0293  glutamate--cysteine ligase GshA  100 
 
 
431 aa  886    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0219  glutamate/cysteine ligase  90.02 
 
 
431 aa  791    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000276666 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3215  hypothetical protein  73.49 
 
 
429 aa  662    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0011  glutamate--cysteine ligase GshA  70.53 
 
 
428 aa  626  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0602184 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3940  glutamate--cysteine ligase  69.7 
 
 
431 aa  623  1e-177  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3259  glutamate/cysteine ligase  69.63 
 
 
431 aa  620  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0191292  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3910  glutamate--cysteine ligase  69.63 
 
 
431 aa  620  1e-176  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.195773  normal  0.80234 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3750  glutamate--cysteine ligase  67.83 
 
 
431 aa  612  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.832044 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4542  glutamate--cysteine ligase  67.29 
 
 
431 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.907644  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2516  glutamate--cysteine ligase GshA  67.37 
 
 
431 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.979828  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5997  glutamate--cysteine ligase  66.67 
 
 
431 aa  602  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0724112  hitchhiker  0.00190947 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2408  glutamate--cysteine ligase GshA  67.29 
 
 
426 aa  598  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0573  glutamate/cysteine ligase  66.82 
 
 
437 aa  595  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0216  glutamate--cysteine ligase GshA  64.79 
 
 
431 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0763  glutamate--cysteine ligase GshA  62.38 
 
 
431 aa  559  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0426  glutamate/cysteine ligase  62.21 
 
 
436 aa  554  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.553194  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1252  glutamate--cysteine ligase  62.47 
 
 
429 aa  544  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1824  glutamate--cysteine ligase GshA  55.37 
 
 
436 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3064  glutamate--cysteine ligase  54.27 
 
 
436 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0913039  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2671  glutamate/cysteine ligase  54.27 
 
 
436 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.630756  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2076  glutamate--cysteine ligase  52.73 
 
 
435 aa  436  1e-121  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000044914  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0105  glutamate--cysteine ligase  52.49 
 
 
435 aa  435  1e-121  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.005063  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1811  hypothetical protein  55.12 
 
 
431 aa  425  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1812  hypothetical protein  55.01 
 
 
431 aa  427  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0513  glutamate/cysteine ligase  50.36 
 
 
449 aa  419  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0125  glutamate--cysteine ligase  36.16 
 
 
410 aa  241  2e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1188  glutamate--cysteine ligase-related protein  34.73 
 
 
386 aa  236  6e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0076  glutamate-cysteine ligase-related protein  38.44 
 
 
408 aa  234  3e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0308  glutamate--cysteine ligase  35.4 
 
 
391 aa  203  4e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>