53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0513 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0513  glutamate/cysteine ligase  100 
 
 
449 aa  935    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2408  glutamate--cysteine ligase GshA  54.63 
 
 
426 aa  488  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0573  glutamate/cysteine ligase  52.97 
 
 
437 aa  465  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2516  glutamate--cysteine ligase GshA  54.61 
 
 
431 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.979828  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0011  glutamate--cysteine ligase GshA  51.51 
 
 
428 aa  456  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0602184 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0216  glutamate--cysteine ligase GshA  51.71 
 
 
431 aa  455  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1824  glutamate--cysteine ligase GshA  50 
 
 
436 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0173  putative glutamate--cysteine ligase  49.65 
 
 
431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.466672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4583  glutamate--cysteine ligase GshA  49.41 
 
 
431 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0293  glutamate--cysteine ligase GshA  50.92 
 
 
431 aa  435  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0219  glutamate/cysteine ligase  51.57 
 
 
431 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000276666 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3064  glutamate--cysteine ligase  52.68 
 
 
436 aa  435  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0913039  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2671  glutamate/cysteine ligase  52.68 
 
 
436 aa  435  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.630756  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0200  glutamate/cysteine ligase  51.57 
 
 
431 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.770755  normal  0.19114 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3940  glutamate--cysteine ligase  48.94 
 
 
431 aa  434  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0344  hypothetical protein  51.08 
 
 
431 aa  428  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3259  glutamate/cysteine ligase  49.18 
 
 
431 aa  426  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0191292  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4542  glutamate--cysteine ligase  49.18 
 
 
431 aa  427  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.907644  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3910  glutamate--cysteine ligase  49.18 
 
 
431 aa  426  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.195773  normal  0.80234 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1955  glutamate--cysteine ligase  49.88 
 
 
432 aa  422  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0242  glutamate--cysteine ligase GshA  50.36 
 
 
431 aa  419  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2076  glutamate--cysteine ligase  49.29 
 
 
435 aa  421  1e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000044914  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3750  glutamate--cysteine ligase  48.24 
 
 
431 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.832044 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0105  glutamate--cysteine ligase  49.29 
 
 
435 aa  421  1e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.005063  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0527  glutamate/cysteine ligase  48.71 
 
 
429 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4188  putative glutamate-cysteine ligase  48.71 
 
 
429 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1660  glutamate--cysteine ligase  49.16 
 
 
432 aa  413  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.851286 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0258  glutamate--cysteine ligase  48 
 
 
429 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5997  glutamate--cysteine ligase  48.24 
 
 
431 aa  408  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0724112  hitchhiker  0.00190947 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0763  glutamate--cysteine ligase GshA  45.41 
 
 
431 aa  392  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1811  hypothetical protein  49.14 
 
 
431 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1812  hypothetical protein  49.14 
 
 
431 aa  386  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2781  glutamate--cysteine ligase  45.88 
 
 
429 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.147429  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2919  glutamate--cysteine ligase  45.88 
 
 
429 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.192205  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2250  glutamate--cysteine ligase GshA  45.65 
 
 
429 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0439  glutamate--cysteine ligase  45.65 
 
 
429 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2864  glutamate--cysteine ligase  45.65 
 
 
429 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00201852  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2875  glutamate--cysteine ligase  45.65 
 
 
429 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.441186  normal  0.177007 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6193  glutamate--cysteine ligase GshA  45.65 
 
 
429 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0426  glutamate/cysteine ligase  45.12 
 
 
436 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.553194  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0470  glutamate--cysteine ligase  45.41 
 
 
429 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0654  glutamate--cysteine ligase  45.41 
 
 
429 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0409  glutamate--cysteine ligase  45.41 
 
 
429 aa  378  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0489  glutamate--cysteine ligase  45.41 
 
 
429 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8441  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0189  glutamate--cysteine ligase  44.94 
 
 
429 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1252  glutamate--cysteine ligase  44.94 
 
 
429 aa  373  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3215  hypothetical protein  44.94 
 
 
429 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2830  glutamate--cysteine ligase  44.94 
 
 
429 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.759245  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1403  glutamate--cysteine ligase  44.94 
 
 
429 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1188  glutamate--cysteine ligase-related protein  35.18 
 
 
386 aa  245  9e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0125  glutamate--cysteine ligase  34.86 
 
 
410 aa  241  2e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0076  glutamate-cysteine ligase-related protein  37.4 
 
 
408 aa  233  6e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0308  glutamate--cysteine ligase  31.48 
 
 
391 aa  193  6e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>