53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0200 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2875  glutamate--cysteine ligase  71.63 
 
 		 429 aa  654    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.441186  normal  0.177007 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0173  putative glutamate--cysteine ligase  70.4 
 
 		 431 aa  641    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.466672 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1403  glutamate--cysteine ligase  72.6 
 
 		 429 aa  653    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0189  glutamate--cysteine ligase  72.6 
 
 		 429 aa  653    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0470  glutamate--cysteine ligase  72.83 
 
 		 429 aa  656    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211009  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0489  glutamate--cysteine ligase  72.83 
 
 		 429 aa  656    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8441  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2830  glutamate--cysteine ligase  72.6 
 
 		 429 aa  653    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.759245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2864  glutamate--cysteine ligase  71.63 
 
 		 429 aa  654    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00201852  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2919  glutamate--cysteine ligase  71.63 
 
 		 429 aa  655    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.192205  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2250  glutamate--cysteine ligase GshA  71.63 
 
 		 429 aa  654    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0242  glutamate--cysteine ligase GshA  89.79 
 
 		 431 aa  788    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4188  putative glutamate-cysteine ligase  75.35 
 
 		 429 aa  692    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1955  glutamate--cysteine ligase  80.84 
 
 		 432 aa  729    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0439  glutamate--cysteine ligase  71.63 
 
 		 429 aa  654    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0409  glutamate--cysteine ligase  72.6 
 
 		 429 aa  652    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1660  glutamate--cysteine ligase  79.67 
 
 		 432 aa  710    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.851286 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2781  glutamate--cysteine ligase  71.63 
 
 		 429 aa  655    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.147429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6193  glutamate--cysteine ligase GshA  71.63 
 
 		 429 aa  655    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0654  glutamate--cysteine ligase  72.83 
 
 		 429 aa  656    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0258  glutamate--cysteine ligase  73.72 
 
 		 429 aa  684    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0527  glutamate/cysteine ligase  75.12 
 
 		 429 aa  692    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0293  glutamate--cysteine ligase GshA  89.79 
 
 		 431 aa  815    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0200  glutamate/cysteine ligase  100 
 
 		 431 aa  889    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.770755  normal  0.19114 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0219  glutamate/cysteine ligase  99.77 
 
 		 431 aa  887    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000276666 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3215  hypothetical protein  72.6 
 
 		 429 aa  653    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0344  hypothetical protein  96.06 
 
 		 431 aa  837    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3940  glutamate--cysteine ligase  69 
 
 		 431 aa  627  1e-178  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4583  glutamate--cysteine ligase GshA  68.76 
 
 		 431 aa  626  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3910  glutamate--cysteine ligase  68.93 
 
 		 431 aa  620  1e-176  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.195773  normal  0.80234 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3259  glutamate/cysteine ligase  68.93 
 
 		 431 aa  620  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0191292  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4542  glutamate--cysteine ligase  68.22 
 
 		 431 aa  615  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.907644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0011  glutamate--cysteine ligase GshA  68.46 
 
 		 428 aa  614  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0602184 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3750  glutamate--cysteine ligase  67.37 
 
 		 431 aa  608  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.832044 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2516  glutamate--cysteine ligase GshA  65.89 
 
 		 431 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5997  glutamate--cysteine ligase  66.9 
 
 		 431 aa  602  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0724112  hitchhiker  0.00190947 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2408  glutamate--cysteine ligase GshA  66.12 
 
 		 426 aa  599  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0573  glutamate/cysteine ligase  65.42 
 
 		 437 aa  590  1e-167  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0216  glutamate--cysteine ligase GshA  64.47 
 
 		 431 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0426  glutamate/cysteine ligase  61.98 
 
 		 436 aa  552  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.553194  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0763  glutamate--cysteine ligase GshA  61.45 
 
 		 431 aa  553  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1252  glutamate--cysteine ligase  62.24 
 
 		 429 aa  541  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1824  glutamate--cysteine ligase GshA  56.83 
 
 		 436 aa  488  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0513  glutamate/cysteine ligase  51.57 
 
 		 449 aa  433  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3064  glutamate--cysteine ligase  52.61 
 
 		 436 aa  434  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0913039  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2671  glutamate/cysteine ligase  52.61 
 
 		 436 aa  434  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.630756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2076  glutamate--cysteine ligase  51.07 
 
 		 435 aa  433  1e-120  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000044914  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0105  glutamate--cysteine ligase  50.83 
 
 		 435 aa  432  1e-120  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.005063  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1811  hypothetical protein  53.41 
 
 		 431 aa  425  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1812  hypothetical protein  52.81 
 
 		 431 aa  423  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0125  glutamate--cysteine ligase  33.42 
 
 		 410 aa  239  6.999999999999999e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1188  glutamate--cysteine ligase-related protein  33.25 
 
 		 386 aa  237  3e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0076  glutamate-cysteine ligase-related protein  35.75 
 
 		 408 aa  231  1e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0308  glutamate--cysteine ligase  34.51 
 
 		 391 aa  205  1e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>