12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4571 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4571  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  705    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0644  hypothetical protein  29.91 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0779934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3749  methyl-accepting chemotaxis protein  38.31 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001845  hypothetical protein  32.71 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3930  hypothetical protein  30 
 
 		 465 aa  72  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.756384  decreased coverage  0.0000317604 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4730  hypothetical protein  31.65 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2060  hypothetical protein  33.94 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.424473 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0493  hypothetical protein  23.23 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1362  hypothetical protein  47.83 
 
 		 471 aa  53.5  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2710  hypothetical protein  47.83 
 
 		 471 aa  53.5  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000730079  normal  0.03873 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2437  hypothetical protein  42.73 
 
 		 349 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.298046 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0299  hypothetical protein  76.47 
 
 		 464 aa  49.3  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>