11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3749 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3749  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 		 368 aa  728    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001845  hypothetical protein  47.7 
 
 		 354 aa  258  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4730  hypothetical protein  47.61 
 
 		 359 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2060  hypothetical protein  39.29 
 
 		 334 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.424473 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4571  hypothetical protein  38.31 
 
 		 356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1362  hypothetical protein  46.67 
 
 		 471 aa  56.6  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2710  hypothetical protein  46.67 
 
 		 471 aa  56.6  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000730079  normal  0.03873 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3930  hypothetical protein  32.3 
 
 		 465 aa  54.7  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.756384  decreased coverage  0.0000317604 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2437  hypothetical protein  42.99 
 
 		 349 aa  47  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.298046 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4768  hypothetical protein  65 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.532508 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0299  hypothetical protein  47.37 
 
 		 464 aa  44.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>