32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2869 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2869  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  493  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0205  hypothetical protein  45 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3782  hypothetical protein  40.21 
 
 		 212 aa  138  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.752159  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4189  hypothetical protein  40.54 
 
 		 201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2441  hypothetical protein  38.38 
 
 		 201 aa  125  8.000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.710457  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26560  hypothetical protein  38.73 
 
 		 210 aa  124  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1706  hypothetical protein  30.18 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0909  hypothetical protein  30.18 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1898  hypothetical protein  30.18 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1196  hypothetical protein  30.18 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0346  hypothetical protein  30.18 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.330293  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0255  hypothetical protein  30.18 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2171  hypothetical protein  30.18 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0026  hypothetical protein  26.92 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.913081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0534  hypothetical protein  26.94 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0544  hypothetical protein  28.81 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0031  hypothetical protein  26.37 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.728008  normal  0.0293912 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0860  putative lipoprotein  28.18 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00330008  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0735  hypothetical protein  28.57 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1683  hypothetical protein  28.57 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2035  hypothetical protein  27.65 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.561287  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2133  hypothetical protein  27.65 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0725  hypothetical protein  27.65 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0614  hypothetical protein  27.65 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.705546  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3426  hypothetical protein  26.34 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2955  hypothetical protein  26.34 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0833098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3555  hypothetical protein  26.34 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0737  hypothetical protein  24.86 
 
 		 236 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437035  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2006  hypothetical protein  24.86 
 
 		 238 aa  42.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367793  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1032  hypothetical protein  24.86 
 
 		 238 aa  42.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2085  hypothetical protein  24.86 
 
 		 238 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.285185  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0449  hypothetical protein  24.86 
 
 		 238 aa  42  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>