35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2441 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2441  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  417  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.710457  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4189  hypothetical protein  79.6 
 
 
201 aa  349  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3782  hypothetical protein  39.58 
 
 
212 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.752159  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0205  hypothetical protein  36.1 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2869  hypothetical protein  38.38 
 
 
244 aa  125  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26560  hypothetical protein  32.32 
 
 
210 aa  109  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1898  hypothetical protein  29.5 
 
 
219 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1706  hypothetical protein  29.5 
 
 
219 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2171  hypothetical protein  29.5 
 
 
219 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0909  hypothetical protein  29.5 
 
 
219 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1196  hypothetical protein  29.5 
 
 
219 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0255  hypothetical protein  29.5 
 
 
219 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0346  hypothetical protein  29.5 
 
 
219 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.330293  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0534  hypothetical protein  29.72 
 
 
228 aa  79.3  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0031  hypothetical protein  27.32 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.728008  normal  0.0293912 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0026  hypothetical protein  25.27 
 
 
216 aa  61.2  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.913081  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1890  hypothetical protein  28.75 
 
 
238 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2006  hypothetical protein  28.75 
 
 
238 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367793  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0449  hypothetical protein  28.75 
 
 
238 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1032  hypothetical protein  28.75 
 
 
238 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0737  hypothetical protein  28.75 
 
 
236 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437035  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0712  hypothetical protein  28.12 
 
 
238 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.827916  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0800  hypothetical protein  28.12 
 
 
238 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.79357  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2085  hypothetical protein  28.12 
 
 
238 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.285185  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3426  hypothetical protein  25.95 
 
 
205 aa  55.5  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2955  hypothetical protein  25.95 
 
 
205 aa  55.5  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0833098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3555  hypothetical protein  25.95 
 
 
205 aa  55.5  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0544  hypothetical protein  24.89 
 
 
256 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1683  hypothetical protein  24.58 
 
 
253 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0735  hypothetical protein  24.58 
 
 
253 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0860  putative lipoprotein  21.99 
 
 
264 aa  48.9  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00330008  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2035  hypothetical protein  23.96 
 
 
212 aa  48.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.561287  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2133  hypothetical protein  23.96 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0725  hypothetical protein  23.96 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0614  hypothetical protein  23.96 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.705546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>