26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3426 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_3555  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  418  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2955  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  418  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0833098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3426  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  418  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0534  hypothetical protein  31.55 
 
 
228 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2441  hypothetical protein  25.95 
 
 
201 aa  55.5  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.710457  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3782  hypothetical protein  26.44 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.752159  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26560  hypothetical protein  25.85 
 
 
210 aa  51.6  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1898  hypothetical protein  25 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2171  hypothetical protein  25 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1196  hypothetical protein  25 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0909  hypothetical protein  25 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1706  hypothetical protein  25 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0346  hypothetical protein  24.48 
 
 
219 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.330293  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0255  hypothetical protein  24.48 
 
 
219 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0800  hypothetical protein  29.22 
 
 
238 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.79357  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0712  hypothetical protein  29.22 
 
 
238 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.827916  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1032  hypothetical protein  28.57 
 
 
238 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2006  hypothetical protein  28.57 
 
 
238 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367793  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0737  hypothetical protein  28.57 
 
 
236 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437035  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1890  hypothetical protein  28.14 
 
 
238 aa  47.8  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0449  hypothetical protein  28.14 
 
 
238 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2085  hypothetical protein  28.57 
 
 
238 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.285185  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2869  hypothetical protein  26.34 
 
 
244 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4189  hypothetical protein  24.7 
 
 
201 aa  45.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0026  hypothetical protein  25.57 
 
 
216 aa  44.3  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.913081  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0031  hypothetical protein  23.03 
 
 
214 aa  42.4  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.728008  normal  0.0293912 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>