More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0908 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0908  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
255 aa  520  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06304  iron(III) ABC transporter ATP-binding protein  64.23 
 
 
261 aa  347  9e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001283  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  65.38 
 
 
261 aa  347  1e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00428043  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2581  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  66.92 
 
 
285 aa  340  1e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00566513  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3769  ABC transporter related  54.12 
 
 
255 aa  288  4e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187611 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0691  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  43.87 
 
 
265 aa  232  4.0000000000000004e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0221  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  43.08 
 
 
265 aa  231  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0209  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  43.08 
 
 
265 aa  231  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0225  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  43.08 
 
 
265 aa  231  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0228  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  43.08 
 
 
265 aa  231  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00150  iron-hydroxamate transporter subunit  43.48 
 
 
265 aa  229  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00128613  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0161  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  43.48 
 
 
265 aa  229  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0155  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  43.48 
 
 
265 aa  229  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00149  hypothetical protein  43.48 
 
 
265 aa  229  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0210  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  43.08 
 
 
265 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3508  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  43.48 
 
 
265 aa  229  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000160242  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0143  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  43.48 
 
 
265 aa  229  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3451  ABC transporter related protein  43.48 
 
 
265 aa  229  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0148611  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0163  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  43.48 
 
 
265 aa  229  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0156  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  43.48 
 
 
265 aa  229  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3462  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  44.4 
 
 
264 aa  229  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0998  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  44.4 
 
 
264 aa  229  4e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3333  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  44.4 
 
 
264 aa  228  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3978  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  42.69 
 
 
265 aa  226  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2814  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  41.34 
 
 
265 aa  226  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204949  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1169  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  40.16 
 
 
310 aa  225  7e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3109  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  40.16 
 
 
286 aa  224  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1010  ABC transporter related  43.78 
 
 
254 aa  223  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2860  ABC transporter related  42.13 
 
 
255 aa  221  7e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.019123  normal  0.0516236 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2780  ABC transporter related  39.92 
 
 
274 aa  221  8e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.382357 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0150  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  43.27 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1306  ABC transporter related  41.27 
 
 
276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1929  ABC Fe+3 siderophore/cobalamin transporter, ATPase subunit  47.09 
 
 
295 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051174  normal  0.251825 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1051  ABC transporter related  40.16 
 
 
255 aa  216  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  40.16 
 
 
259 aa  214  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50330  iron(III)-siderophore ABC transporter ATP-binding protein  41.34 
 
 
255 aa  211  7.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.219188  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003570  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  43.97 
 
 
254 aa  211  9e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6474  ABC transporter related  40 
 
 
269 aa  204  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.820871  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3476  ABC transporter related  40.16 
 
 
260 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2188  ABC transporter related  41.15 
 
 
257 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0753  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  39.36 
 
 
254 aa  203  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.122514  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  37.35 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0086  ABC transporter related  38.34 
 
 
255 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1142  ABC transporter related  39.27 
 
 
255 aa  198  7.999999999999999e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3581  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ferrichrome)  39.22 
 
 
271 aa  196  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1437  ABC Fe+3 hydroxamate (ferrichrome) transporter, ATPase subunit  38.74 
 
 
255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  35.97 
 
 
258 aa  193  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4124  ABC transporter related  41.78 
 
 
291 aa  191  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1102  ABC transporter related  38.19 
 
 
254 aa  188  5.999999999999999e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0810  putative ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  39.22 
 
 
260 aa  186  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.024008  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7397  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  41.33 
 
 
290 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  36.65 
 
 
268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02590  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  40.64 
 
 
302 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  38.59 
 
 
271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0336  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components  38.17 
 
 
273 aa  182  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1239  ABC transporter related  36.93 
 
 
292 aa  182  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.469823  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  40 
 
 
267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0797  ferrichrome ABC transporter ATP-binding protein  38.79 
 
 
260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274021  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  39.6 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  40 
 
 
265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  40 
 
 
265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1803  ABC transporter related  38.52 
 
 
267 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  38.17 
 
 
274 aa  181  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55040  putative ATP-binding component of ferric enterobactin transport  37.76 
 
 
285 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000063411  unclonable  1.8990000000000002e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0686  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.51 
 
 
273 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4682  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  36.51 
 
 
273 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.207042  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0655  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  36.51 
 
 
273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.51 
 
 
273 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0014346  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  35.62 
 
 
263 aa  179  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  37.76 
 
 
266 aa  179  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5053  ABC transporter related  38.02 
 
 
271 aa  179  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0584  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.51 
 
 
273 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  36.51 
 
 
273 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.37672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  36.51 
 
 
273 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0618  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.51 
 
 
273 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0532  ABC transporter related  36.51 
 
 
273 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.969378  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7287  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron (III) dicitrate)  36.55 
 
 
264 aa  179  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2593  ABC transporter  36.93 
 
 
263 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295481  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2204  ABC transporter related protein  35.27 
 
 
271 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.166445  hitchhiker  0.000194766 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0702  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  39.45 
 
 
264 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0643  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  39.45 
 
 
264 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5948  ABC transporter related  34.85 
 
 
330 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.119388  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0629  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  39.45 
 
 
264 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.781197  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0673  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.1 
 
 
273 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2296700000000006e-24 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4300  ABC transporter related  38.03 
 
 
303 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  decreased coverage  0.0000186519 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0748  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  39.45 
 
 
264 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0686  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  39.45 
 
 
264 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.926109 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0305  ABC transporter related protein  36.91 
 
 
283 aa  176  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0672  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  39.45 
 
 
271 aa  176  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  34.98 
 
 
293 aa  176  5e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  36.8 
 
 
255 aa  176  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2759  ABC transporter-related protein  41.33 
 
 
263 aa  175  8e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.078515  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00555  iron-enterobactin transporter subunit  39.45 
 
 
271 aa  174  9e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3038  ABC transporter related protein  39.45 
 
 
271 aa  174  9e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0639  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  39.45 
 
 
271 aa  174  9e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3056  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  39.45 
 
 
271 aa  174  9e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0466  ABC transporter related  39.67 
 
 
286 aa  174  9e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  39.45 
 
 
271 aa  174  9e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  39.45 
 
 
271 aa  174  9e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20790  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  37.61 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465505  normal  0.0251989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>