57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0255 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0359  transposase  99.83 
 
 		 1194 bp  2351    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.36865  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3056  transposase  100 
 
 		 1194 bp  2367    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0017  transposase  99.58 
 
 		 1191 bp  2323    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0045    99.9 
 
 		 984 bp  1943    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32074  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0084  transposase  99.75 
 
 		 1194 bp  2343    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0106  transposase  99.58 
 
 		 1191 bp  2323    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0107  transposase  99.92 
 
 		 1194 bp  2359    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0117  transposase  99.92 
 
 		 1194 bp  2359    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0129    99.72 
 
 		 2927 bp  2841    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0130  transposase  99.83 
 
 		 1194 bp  2351    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0188  transposase  99.92 
 
 		 1194 bp  2359    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0202  transposase  99.92 
 
 		 1194 bp  2359    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0529796  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0208  transposase  99.91 
 
 		 1080 bp  2133    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0255    100 
 
 		 2363 bp  4684    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.809187  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0256  transposase  100 
 
 		 1194 bp  2367    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.268648  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3039  transposase  99.66 
 
 		 1191 bp  2331    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0442  transposase  99.83 
 
 		 1194 bp  2351    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0828    99.86 
 
 		 2486 bp  2839    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.306427  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0829  transposase  99.83 
 
 		 1194 bp  2351    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.302329  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0875  transposase  99.83 
 
 		 1194 bp  2351    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0900  transposase  99.83 
 
 		 1194 bp  2351    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0970  transposase  99.75 
 
 		 1191 bp  2339    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0151073  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0990  transposase  99.83 
 
 		 1194 bp  2351    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1048  transposase  99.92 
 
 		 1194 bp  2359    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1086  transposase  99.92 
 
 		 1194 bp  2359    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1097  transposase  99.92 
 
 		 1194 bp  2359    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.930586  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_18  putative transposase  99.81 
 
 		 1080 bp  2125    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.424546  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_26  putative transposase  99.81 
 
 		 1080 bp  2125    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181682  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_03  transposase, IS91 family  99.81 
 
 		 1080 bp  2125    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517825  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3035  transposase  100 
 
 		 1194 bp  2367    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0013    99.65 
 
 		 2490 bp  2809    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0014  transposase  99.58 
 
 		 1191 bp  2323    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0019  transposase  99.75 
 
 		 1194 bp  2343    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0022  transposase  100 
 
 		 1194 bp  2367    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0035  transposase  99.75 
 
 		 1191 bp  2339    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0040  transposase  99.83 
 
 		 1194 bp  2351    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0050  transposase  99.92 
 
 		 1194 bp  2359    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.677312  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0056  transposase  99.83 
 
 		 1194 bp  2351    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0131  transposase  99.66 
 
 		 1191 bp  2331    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1001  transposase  99.83 
 
 		 1194 bp  2351    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1335  transposase  99.83 
 
 		 1194 bp  2351    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2969  transposase  100 
 
 		 1194 bp  2367    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.130301  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2853  transposase  99.92 
 
 		 1194 bp  2359    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652779  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1720  transposase  99.63 
 
 		 1077 bp  2105    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1708  transposase  99.75 
 
 		 1191 bp  2339    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.53086  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1707    99.79 
 
 		 1876 bp  2825    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1683  transposase  99.91 
 
 		 1080 bp  2133    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1445  transposase  100 
 
 		 1194 bp  2367    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1430  transposase  99.83 
 
 		 1194 bp  2351    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178095  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1166  transposase  99.92 
 
 		 1194 bp  2359    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0692349  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  84.31 
 
 		 921 bp  75.8  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0860  agmatinase  86.76 
 
 		 930 bp  63.9  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.806171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  82.24 
 
 		 930 bp  61.9  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0946  agmatinase  88.68 
 
 		 969 bp  58  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2027  agmatinase  86.79 
 
 		 963 bp  50.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0643  agmatinase  86.79 
 
 		 963 bp  50.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0735  agmatinase  86.79 
 
 		 963 bp  50.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>