18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2711 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2711  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  181  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2393  hypothetical protein  48 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773269  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1554  hypothetical protein  46.67 
 
 		 79 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1584  hypothetical protein  46.67 
 
 		 79 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1550  hypothetical protein  45.33 
 
 		 79 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2370  hypothetical protein  45 
 
 		 80 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1746  hypothetical protein  54.1 
 
 		 79 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2711  hypothetical protein  49.18 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2544  hypothetical protein  49.18 
 
 		 79 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2611  hypothetical protein  49.18 
 
 		 79 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3213  hypothetical protein  48.78 
 
 		 83 aa  67  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.447452  hitchhiker  0.000000222893 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2216  hypothetical protein  47.76 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2796  hypothetical protein  48 
 
 		 79 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3362  hypothetical protein  46.05 
 
 		 83 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3104  hypothetical protein  42.67 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00039  hypothetical protein  46.27 
 
 		 97 aa  62  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002316  hypothetical protein  46.27 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1450  hypothetical protein  43.94 
 
 		 82 aa  57.8  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>