18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3213 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3213  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  169  9e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.447452  hitchhiker  0.000000222893 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1554  hypothetical protein  70.67 
 
 		 79 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1584  hypothetical protein  70.67 
 
 		 79 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1550  hypothetical protein  70.67 
 
 		 79 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2393  hypothetical protein  66.67 
 
 		 86 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773269  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2544  hypothetical protein  73.77 
 
 		 79 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2611  hypothetical protein  73.77 
 
 		 79 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2711  hypothetical protein  72.13 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2796  hypothetical protein  70.67 
 
 		 79 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1746  hypothetical protein  67.21 
 
 		 79 aa  100  7e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3362  hypothetical protein  65.79 
 
 		 83 aa  97.4  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1450  hypothetical protein  62.2 
 
 		 82 aa  92.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2370  hypothetical protein  50.65 
 
 		 80 aa  87.8  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3104  hypothetical protein  54.67 
 
 		 96 aa  87.4  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2711  hypothetical protein  48.78 
 
 		 87 aa  81.6  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00039  hypothetical protein  50.75 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002316  hypothetical protein  49.25 
 
 		 89 aa  71.2  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2216  hypothetical protein  44.93 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>