18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00039 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00039  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  201  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002316  hypothetical protein  84.88 
 
 
89 aa  155  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2216  hypothetical protein  71.76 
 
 
87 aa  135  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2393  hypothetical protein  50 
 
 
86 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773269  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1554  hypothetical protein  45.78 
 
 
79 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1584  hypothetical protein  45.78 
 
 
79 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1550  hypothetical protein  45.78 
 
 
79 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2370  hypothetical protein  47.76 
 
 
80 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2611  hypothetical protein  49.18 
 
 
79 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2544  hypothetical protein  49.18 
 
 
79 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2711  hypothetical protein  46.15 
 
 
94 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3213  hypothetical protein  47.54 
 
 
83 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.447452  hitchhiker  0.000000222893 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1746  hypothetical protein  49.18 
 
 
79 aa  62.8  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2711  hypothetical protein  46.27 
 
 
87 aa  62  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3104  hypothetical protein  44.78 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2796  hypothetical protein  45.9 
 
 
79 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3362  hypothetical protein  45.9 
 
 
83 aa  58.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1450  hypothetical protein  45.45 
 
 
82 aa  55.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>