18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2370 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2370  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1554  hypothetical protein  50.63 
 
 		 79 aa  90.1  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1584  hypothetical protein  50.63 
 
 		 79 aa  90.1  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2393  hypothetical protein  51.95 
 
 		 86 aa  88.2  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773269  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1550  hypothetical protein  49.37 
 
 		 79 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2544  hypothetical protein  60.66 
 
 		 79 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2611  hypothetical protein  60.66 
 
 		 79 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1746  hypothetical protein  57.38 
 
 		 79 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2711  hypothetical protein  55.74 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3213  hypothetical protein  50.65 
 
 		 83 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.447452  hitchhiker  0.000000222893 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2796  hypothetical protein  49.37 
 
 		 79 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3362  hypothetical protein  57.38 
 
 		 83 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1450  hypothetical protein  54.55 
 
 		 82 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2216  hypothetical protein  45.68 
 
 		 87 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3104  hypothetical protein  43.04 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2711  hypothetical protein  45 
 
 		 87 aa  71.2  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00039  hypothetical protein  47.76 
 
 		 97 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002316  hypothetical protein  46.27 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>