18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2611 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2544  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2611  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2711  hypothetical protein  94.94 
 
 		 94 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1554  hypothetical protein  78.48 
 
 		 79 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1584  hypothetical protein  78.48 
 
 		 79 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1550  hypothetical protein  77.22 
 
 		 79 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1746  hypothetical protein  86.08 
 
 		 79 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2796  hypothetical protein  79.75 
 
 		 79 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2393  hypothetical protein  68 
 
 		 86 aa  114  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773269  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3213  hypothetical protein  73.77 
 
 		 83 aa  107  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.447452  hitchhiker  0.000000222893 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1450  hypothetical protein  71.21 
 
 		 82 aa  98.6  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3104  hypothetical protein  59.49 
 
 		 96 aa  98.2  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2370  hypothetical protein  53.16 
 
 		 80 aa  95.5  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3362  hypothetical protein  63.16 
 
 		 83 aa  92.8  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2711  hypothetical protein  47.37 
 
 		 87 aa  77  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00039  hypothetical protein  45.78 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2216  hypothetical protein  43.37 
 
 		 87 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002316  hypothetical protein  44.58 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>