18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002052 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002052  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  386  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00396  hypothetical protein  76.78 
 
 		 211 aa  288  5.0000000000000004e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2478  hypothetical protein  43.3 
 
 		 218 aa  154  9e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4162  hypothetical protein  35.6 
 
 		 220 aa  90.5  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4836  hypothetical protein  35.26 
 
 		 222 aa  85.5  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4444  hypothetical protein  33.99 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0114  hypothetical protein  30.98 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0110  hypothetical protein  33.68 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.338724  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0114  hypothetical protein  35.2 
 
 		 208 aa  72  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0119  hypothetical protein  34.69 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4240  hypothetical protein  32.12 
 
 		 208 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0118  hypothetical protein  34.18 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0110  hypothetical protein  32.22 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0115  hypothetical protein  32.22 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.651645 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3754  hypothetical protein  31.36 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154539 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3611  hypothetical protein  30.58 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00237944  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0115  hypothetical protein  30.57 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0368167 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0085  hypothetical protein  28.41 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.352391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>