18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0115 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0115  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  425  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0368167 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0114  hypothetical protein  79.81 
 
 
203 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0115  hypothetical protein  85.98 
 
 
206 aa  310  9e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.651645 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0110  hypothetical protein  85.98 
 
 
206 aa  310  9e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0119  hypothetical protein  76.8 
 
 
208 aa  291  4e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0114  hypothetical protein  76.29 
 
 
208 aa  290  8e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0118  hypothetical protein  75.77 
 
 
208 aa  289  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4240  hypothetical protein  76.29 
 
 
208 aa  286  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0110  hypothetical protein  73.06 
 
 
208 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.338724  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3611  hypothetical protein  62.87 
 
 
229 aa  210  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00237944  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4836  hypothetical protein  53.2 
 
 
222 aa  206  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4162  hypothetical protein  48.66 
 
 
220 aa  195  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4444  hypothetical protein  45.79 
 
 
208 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0085  hypothetical protein  48.96 
 
 
174 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.352391  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3754  hypothetical protein  48 
 
 
225 aa  169  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0154539 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002052  hypothetical protein  34.81 
 
 
194 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00396  hypothetical protein  35.33 
 
 
211 aa  61.6  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2478  hypothetical protein  23.6 
 
 
218 aa  55.5  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>