18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4162 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_4162  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4836  hypothetical protein  60 
 
 
222 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4444  hypothetical protein  56.82 
 
 
208 aa  240  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3754  hypothetical protein  53.98 
 
 
225 aa  225  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0154539 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0110  hypothetical protein  48 
 
 
208 aa  192  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.338724  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0114  hypothetical protein  51.02 
 
 
203 aa  190  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0119  hypothetical protein  48.22 
 
 
208 aa  184  7e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0114  hypothetical protein  47.72 
 
 
208 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4240  hypothetical protein  47.72 
 
 
208 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0118  hypothetical protein  47.72 
 
 
208 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0115  hypothetical protein  48.26 
 
 
206 aa  175  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.651645 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0110  hypothetical protein  48.26 
 
 
206 aa  175  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0115  hypothetical protein  48.51 
 
 
213 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0368167 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3611  hypothetical protein  44.12 
 
 
229 aa  149  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00237944  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0085  hypothetical protein  38.78 
 
 
174 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.352391  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002052  hypothetical protein  34.9 
 
 
194 aa  85.5  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00396  hypothetical protein  31.16 
 
 
211 aa  64.7  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2478  hypothetical protein  26.11 
 
 
218 aa  55.5  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>