18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3754 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3754  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  463  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154539 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4162  hypothetical protein  54.42 
 
 		 220 aa  238  5e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4444  hypothetical protein  51.56 
 
 		 208 aa  208  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4836  hypothetical protein  49.56 
 
 		 222 aa  207  9e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0110  hypothetical protein  46.86 
 
 		 208 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.338724  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0114  hypothetical protein  46.94 
 
 		 203 aa  169  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0114  hypothetical protein  47.21 
 
 		 208 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0119  hypothetical protein  47.21 
 
 		 208 aa  164  8e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4240  hypothetical protein  47.21 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0118  hypothetical protein  46.7 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0115  hypothetical protein  46.97 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.651645 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0110  hypothetical protein  46.97 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0115  hypothetical protein  46.19 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0368167 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3611  hypothetical protein  41.63 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00237944  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0085  hypothetical protein  39.09 
 
 		 174 aa  129  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.352391  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002052  hypothetical protein  29.65 
 
 		 194 aa  61.6  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2478  hypothetical protein  28.48 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00396  hypothetical protein  29.59 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>