18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1729 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1729  hypothetical protein  100 
 
 		 639 aa  1289    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.159419  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0323  putative lipoprotein  31.37 
 
 		 467 aa  132  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0296  hypothetical protein  30.77 
 
 		 464 aa  131  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1569  hypothetical protein  27.13 
 
 		 939 aa  101  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.150987 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1570  hypothetical protein  27.88 
 
 		 494 aa  98.2  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.322459 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0709  hypothetical protein  28.11 
 
 		 511 aa  95.5  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.166464  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0322  hypothetical protein  25.18 
 
 		 439 aa  94.7  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0297  hypothetical protein  25.83 
 
 		 441 aa  93.2  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.934233  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0062  membrane protein  26.4 
 
 		 494 aa  92.8  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3129  hypothetical protein  27.22 
 
 		 448 aa  92  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3130  hypothetical protein  27.47 
 
 		 682 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.3157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0324  putative lipoprotein  26.18 
 
 		 466 aa  77.8  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0295  hypothetical protein  26.32 
 
 		 462 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0291  hypothetical protein  22.81 
 
 		 484 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0547  twin-arginine translocation pathway signal  24.94 
 
 		 849 aa  57.8  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0347  hypothetical protein  26.38 
 
 		 642 aa  46.6  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.379451  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0905  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 1181 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000345884 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  26.81 
 
 		 1036 aa  44.3  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>