15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0709 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0709  hypothetical protein  100 
 
 		 511 aa  1029    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.166464  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0297  hypothetical protein  38.95 
 
 		 441 aa  355  1e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.934233  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0322  hypothetical protein  39.59 
 
 		 439 aa  347  3e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1569  hypothetical protein  35.7 
 
 		 939 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.150987 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1570  hypothetical protein  36.14 
 
 		 494 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.322459 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0296  hypothetical protein  34.46 
 
 		 464 aa  258  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0323  putative lipoprotein  33.56 
 
 		 467 aa  256  5e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3130  hypothetical protein  41.39 
 
 		 682 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.3157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3129  hypothetical protein  39.31 
 
 		 448 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0324  putative lipoprotein  33.59 
 
 		 466 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0295  hypothetical protein  31.63 
 
 		 462 aa  193  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0062  membrane protein  30.55 
 
 		 494 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0291  hypothetical protein  24.62 
 
 		 484 aa  137  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1729  hypothetical protein  28.11 
 
 		 639 aa  96.3  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.159419  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0547  twin-arginine translocation pathway signal  23.85 
 
 		 849 aa  77.4  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>