15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0062 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0062  membrane protein  100 
 
 		 494 aa  1020    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0291  hypothetical protein  46.91 
 
 		 484 aa  414  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3130  hypothetical protein  31.97 
 
 		 682 aa  186  9e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.3157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1570  hypothetical protein  28.82 
 
 		 494 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.322459 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0297  hypothetical protein  32.47 
 
 		 441 aa  182  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.934233  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0322  hypothetical protein  30.93 
 
 		 439 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0323  putative lipoprotein  33.08 
 
 		 467 aa  177  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1569  hypothetical protein  30.37 
 
 		 939 aa  172  9e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.150987 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0296  hypothetical protein  31.7 
 
 		 464 aa  172  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3129  hypothetical protein  31.91 
 
 		 448 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0709  hypothetical protein  30.55 
 
 		 511 aa  158  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.166464  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0295  hypothetical protein  28.57 
 
 		 462 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0324  putative lipoprotein  28.28 
 
 		 466 aa  123  9e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1729  hypothetical protein  26.4 
 
 		 639 aa  100  6e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.159419  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0547  twin-arginine translocation pathway signal  22.36 
 
 		 849 aa  55.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>