13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4136 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4136  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  296  8e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1131  hypothetical protein  36.17 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00302689  normal  0.703813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5675  hypothetical protein  34.48 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61396  decreased coverage  0.000970762 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5428  hypothetical protein  32.87 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5049  hypothetical protein  32.87 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5137  hypothetical protein  32.87 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1057  hypothetical protein  45.71 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.424497  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4703  hypothetical protein  31.51 
 
 		 168 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0124469 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0122  hypothetical protein  32.09 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4198  hypothetical protein  31.25 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.912124  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  33.66 
 
 		 354 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0152  hypothetical protein  31.87 
 
 		 170 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26760  hypothetical protein  28 
 
 		 178 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14308  normal  0.557708 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>