21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4198 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4198  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  352  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.912124  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4703  hypothetical protein  43.95 
 
 		 168 aa  131  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0124469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5077  hypothetical protein  43.48 
 
 		 168 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0984247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3101  hypothetical protein  42.65 
 
 		 169 aa  124  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148369  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0122  hypothetical protein  39.86 
 
 		 167 aa  94.4  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4646  hypothetical protein  37.67 
 
 		 174 aa  93.6  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0250734  normal  0.980042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8935  hypothetical protein  36.97 
 
 		 179 aa  93.6  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00543582  normal  0.426829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3237  hypothetical protein  37.23 
 
 		 173 aa  85.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0152  hypothetical protein  35 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4211  hypothetical protein  32.37 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4209  hypothetical protein  30.41 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26760  hypothetical protein  30.73 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14308  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1549  hypothetical protein  34.07 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0808591  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4282  hypothetical protein  28.21 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1948  hypothetical protein  30.63 
 
 		 132 aa  52  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.841214  normal  0.0350761 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1131  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00302689  normal  0.703813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5675  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61396  decreased coverage  0.000970762 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5428  hypothetical protein  28.87 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5137  hypothetical protein  28.87 
 
 		 163 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5049  hypothetical protein  28.87 
 
 		 163 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4136  hypothetical protein  36.36 
 
 		 150 aa  42.4  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>