21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5077 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5077  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  343  8e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0984247  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3237  hypothetical protein  47.93 
 
 
173 aa  157  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4703  hypothetical protein  42.34 
 
 
168 aa  121  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0124469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3101  hypothetical protein  41.14 
 
 
169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148369  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4198  hypothetical protein  43.48 
 
 
174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.912124  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4646  hypothetical protein  42.45 
 
 
174 aa  105  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0250734  normal  0.980042 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1549  hypothetical protein  38.93 
 
 
194 aa  90.1  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0808591  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0122  hypothetical protein  36.88 
 
 
167 aa  87.4  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8935  hypothetical protein  32.48 
 
 
179 aa  85.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00543582  normal  0.426829 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0152  hypothetical protein  34.78 
 
 
170 aa  85.5  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26760  hypothetical protein  30.16 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14308  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4282  hypothetical protein  30.33 
 
 
165 aa  58.9  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4211  hypothetical protein  26.56 
 
 
160 aa  58.5  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4209  hypothetical protein  24.03 
 
 
160 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4024  hypothetical protein  35.14 
 
 
187 aa  53.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1131  hypothetical protein  34.51 
 
 
163 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00302689  normal  0.703813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5675  hypothetical protein  34.04 
 
 
163 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61396  decreased coverage  0.000970762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1948  hypothetical protein  28.35 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.841214  normal  0.0350761 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5049  hypothetical protein  32.62 
 
 
163 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5428  hypothetical protein  32.62 
 
 
163 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5137  hypothetical protein  32.62 
 
 
163 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>