20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0152 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0152  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  345  2e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0122  hypothetical protein  58.93 
 
 
167 aa  208  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5077  hypothetical protein  34.78 
 
 
168 aa  85.5  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0984247  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3101  hypothetical protein  34.88 
 
 
169 aa  82  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148369  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4703  hypothetical protein  35.04 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0124469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4198  hypothetical protein  35 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.912124  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3237  hypothetical protein  32.41 
 
 
173 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4646  hypothetical protein  31.98 
 
 
174 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0250734  normal  0.980042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8935  hypothetical protein  34.4 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00543582  normal  0.426829 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4211  hypothetical protein  35.83 
 
 
160 aa  62.4  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1549  hypothetical protein  30.53 
 
 
194 aa  60.1  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0808591  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4209  hypothetical protein  30.16 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26760  hypothetical protein  29.23 
 
 
178 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14308  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4024  hypothetical protein  29.09 
 
 
187 aa  42.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1131  hypothetical protein  32.97 
 
 
163 aa  42.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00302689  normal  0.703813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5675  hypothetical protein  34.07 
 
 
163 aa  42.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61396  decreased coverage  0.000970762 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5428  hypothetical protein  33.77 
 
 
163 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5137  hypothetical protein  33.77 
 
 
163 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5049  hypothetical protein  33.77 
 
 
163 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1948  hypothetical protein  30.91 
 
 
132 aa  40.8  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.841214  normal  0.0350761 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>