22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4703 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4703  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  342  1e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0124469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5077  hypothetical protein  42.34 
 
 		 168 aa  121  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0984247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4198  hypothetical protein  43.95 
 
 		 174 aa  120  8e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.912124  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3237  hypothetical protein  41.94 
 
 		 173 aa  108  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3101  hypothetical protein  36.77 
 
 		 169 aa  99.4  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148369  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0122  hypothetical protein  34.51 
 
 		 167 aa  86.3  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26760  hypothetical protein  35.06 
 
 		 178 aa  85.9  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.14308  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4646  hypothetical protein  35.71 
 
 		 174 aa  85.1  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0250734  normal  0.980042 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0152  hypothetical protein  35.04 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8935  hypothetical protein  31.61 
 
 		 179 aa  77.4  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00543582  normal  0.426829 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5675  hypothetical protein  33.78 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61396  decreased coverage  0.000970762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1948  hypothetical protein  34.55 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.841214  normal  0.0350761 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4282  hypothetical protein  30.89 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1549  hypothetical protein  25.18 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0808591  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1131  hypothetical protein  31.29 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00302689  normal  0.703813 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4211  hypothetical protein  25.38 
 
 		 160 aa  51.2  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4514  hypothetical protein  26.9 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.317582  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4209  hypothetical protein  23.85 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4024  hypothetical protein  34.25 
 
 		 187 aa  45.1  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5049  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5428  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5137  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>