26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1815 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0903  GTPase-like protein  76.77 
 
 
440 aa  733    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0782  hypothetical protein  83.94 
 
 
447 aa  778    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000927739  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1815  GTPase-like protein  100 
 
 
444 aa  905    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0234  GTPase-like protein  69.12 
 
 
435 aa  639    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0152  hypothetical protein  71.56 
 
 
443 aa  660    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2173  hypothetical protein  64.38 
 
 
437 aa  591  1e-168  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00111968  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0227  hypothetical protein  60.37 
 
 
437 aa  556  1e-157  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0046  hypothetical protein  58.05 
 
 
442 aa  544  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1818  hypothetical protein  59.22 
 
 
445 aa  529  1e-149  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0692  hypothetical protein  59.5 
 
 
452 aa  526  1e-148  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0567  hypothetical protein  53.88 
 
 
441 aa  501  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2360  hypothetical protein  55.53 
 
 
449 aa  498  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2410  hypothetical protein  55.53 
 
 
449 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2785  hypothetical protein  53.95 
 
 
442 aa  495  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.837703  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2802  hypothetical protein  54.3 
 
 
469 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.692677 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1388  hypothetical protein  55.76 
 
 
456 aa  485  1e-136  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1958  GTPase-like protein  54.95 
 
 
444 aa  482  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3625  hypothetical protein  54.21 
 
 
449 aa  478  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2893  hypothetical protein  53.52 
 
 
511 aa  476  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.864733  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2486  hypothetical protein  53.53 
 
 
439 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0444941  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2310  hypothetical protein  50.79 
 
 
448 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1497  GTPase  48.71 
 
 
447 aa  435  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827889  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1675  hypothetical protein  47.4 
 
 
435 aa  396  1e-109  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1791  hypothetical protein  47.18 
 
 
435 aa  395  1e-108  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0297999 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0520  hypothetical protein  47.05 
 
 
433 aa  391  1e-107  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.238384  normal  0.0237969 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1603  hypothetical protein  43.41 
 
 
433 aa  369  1e-101  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.623678  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>