27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2173 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2173  hypothetical protein  100 
 
 
437 aa  896    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00111968  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0234  GTPase-like protein  65.03 
 
 
435 aa  605  9.999999999999999e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1815  GTPase-like protein  64.38 
 
 
444 aa  591  1e-168  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0782  hypothetical protein  65.68 
 
 
447 aa  594  1e-168  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000927739  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0152  hypothetical protein  65.68 
 
 
443 aa  592  1e-168  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0903  GTPase-like protein  65.21 
 
 
440 aa  590  1e-167  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0046  hypothetical protein  58.2 
 
 
442 aa  541  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0227  hypothetical protein  59.91 
 
 
437 aa  536  1e-151  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2802  hypothetical protein  57.04 
 
 
469 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.692677 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1818  hypothetical protein  57.54 
 
 
445 aa  522  1e-147  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2360  hypothetical protein  56.45 
 
 
449 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2410  hypothetical protein  56.45 
 
 
449 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0567  hypothetical protein  56.74 
 
 
441 aa  511  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2785  hypothetical protein  55.08 
 
 
442 aa  500  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.837703  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0692  hypothetical protein  54.63 
 
 
452 aa  488  1e-137  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2310  hypothetical protein  57 
 
 
448 aa  486  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2893  hypothetical protein  55.5 
 
 
511 aa  483  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.864733  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3625  hypothetical protein  54.21 
 
 
449 aa  478  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1388  hypothetical protein  54.87 
 
 
456 aa  473  1e-132  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2486  hypothetical protein  55.32 
 
 
439 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0444941  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1958  GTPase-like protein  55.14 
 
 
444 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1497  GTPase  48.11 
 
 
447 aa  436  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827889  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1675  hypothetical protein  46.56 
 
 
435 aa  379  1e-104  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0520  hypothetical protein  46.33 
 
 
433 aa  379  1e-104  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.238384  normal  0.0237969 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1791  hypothetical protein  46.56 
 
 
435 aa  372  1e-102  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0297999 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1603  hypothetical protein  44.95 
 
 
433 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.623678  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3228  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  27.33 
 
 
360 aa  43.9  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>