26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1388 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1388  hypothetical protein  100 
 
 
456 aa  929    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0152  hypothetical protein  56.59 
 
 
443 aa  510  1e-143  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0227  hypothetical protein  54.13 
 
 
437 aa  487  1e-136  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0782  hypothetical protein  57.31 
 
 
447 aa  487  1e-136  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000927739  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1815  GTPase-like protein  55.76 
 
 
444 aa  485  1e-136  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0234  GTPase-like protein  54.55 
 
 
435 aa  475  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2173  hypothetical protein  54.87 
 
 
437 aa  473  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00111968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1818  hypothetical protein  52.86 
 
 
445 aa  467  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0046  hypothetical protein  54.52 
 
 
442 aa  467  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0903  GTPase-like protein  54.76 
 
 
440 aa  466  9.999999999999999e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0567  hypothetical protein  53.35 
 
 
441 aa  462  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0692  hypothetical protein  55.24 
 
 
452 aa  456  1e-127  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2893  hypothetical protein  54.07 
 
 
511 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.864733  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2802  hypothetical protein  51.58 
 
 
469 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.692677 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2785  hypothetical protein  52.11 
 
 
442 aa  441  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.837703  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2410  hypothetical protein  51.42 
 
 
449 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2360  hypothetical protein  51.67 
 
 
449 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1958  GTPase-like protein  50.45 
 
 
444 aa  426  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2486  hypothetical protein  51.83 
 
 
439 aa  423  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0444941  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1497  GTPase  47.36 
 
 
447 aa  421  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827889  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3625  hypothetical protein  50.71 
 
 
449 aa  411  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2310  hypothetical protein  50.24 
 
 
448 aa  402  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1791  hypothetical protein  50.48 
 
 
435 aa  383  1e-105  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0297999 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0520  hypothetical protein  48.51 
 
 
433 aa  382  1e-105  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.238384  normal  0.0237969 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1675  hypothetical protein  47.85 
 
 
435 aa  375  1e-103  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1603  hypothetical protein  48.09 
 
 
433 aa  367  1e-100  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.623678  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>