14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0613 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0613  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  42.37 
 
 
374 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1176  nuclease  47.92 
 
 
282 aa  49.7  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  52.38 
 
 
276 aa  47  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  43.75 
 
 
346 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  42.31 
 
 
190 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  42.31 
 
 
190 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  33.33 
 
 
263 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  48.89 
 
 
258 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  48 
 
 
350 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  38.03 
 
 
153 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  40 
 
 
178 aa  41.6  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  41.67 
 
 
323 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  41.67 
 
 
324 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>