20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4940 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4940    100 
 
 
460 bp  912    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4896    98.49 
 
 
612 bp  856    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1717  hypothetical protein  85.75 
 
 
750 bp  365  7.0000000000000005e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0067    83.19 
 
 
636 bp  272  8e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.80103  normal  0.0650966 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1094    82.04 
 
 
478 bp  204  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1691    82.04 
 
 
478 bp  204  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.074278  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3092    82.04 
 
 
478 bp  204  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3128    82.04 
 
 
478 bp  204  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.836092  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4251    82.04 
 
 
562 bp  204  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4928    82.04 
 
 
792 bp  204  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4934    82.04 
 
 
478 bp  204  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4552    81.8 
 
 
792 bp  196  4e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1395  hypothetical protein  87.34 
 
 
270 bp  155  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1082  hypothetical protein  84.58 
 
 
249 bp  153  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4916  hypothetical protein  83.93 
 
 
303 bp  119  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1083    82.47 
 
 
556 bp  97.6  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4914    82.47 
 
 
557 bp  97.6  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4885    87.5 
 
 
368 bp  93.7  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1295    95.56 
 
 
499 bp  65.9  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00092664  normal  0.295207 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0061    78.79 
 
 
243 bp  60  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.063421 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>