16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4885 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4885    100 
 
 
368 bp  729    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1295    91.89 
 
 
499 bp  430  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00092664  normal  0.295207 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1717  hypothetical protein  83.63 
 
 
750 bp  226  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0067    82.7 
 
 
636 bp  208  8e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.80103  normal  0.0650966 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4896    81.53 
 
 
612 bp  159  7e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1083    80.99 
 
 
556 bp  139  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4552    80.99 
 
 
792 bp  139  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4914    80.99 
 
 
557 bp  139  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4928    80.99 
 
 
792 bp  139  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3128    87.14 
 
 
478 bp  127  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.836092  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4251    82.08 
 
 
562 bp  127  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1094    86.43 
 
 
478 bp  119  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1691    86.43 
 
 
478 bp  119  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.074278  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3092    86.43 
 
 
478 bp  119  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4934    86.43 
 
 
478 bp  119  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4940    87.5 
 
 
460 bp  93.7  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>