21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0067 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0067    100 
 
 
636 bp  1261    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.80103  normal  0.0650966 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1717  hypothetical protein  95.29 
 
 
750 bp  1005    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4896    83.39 
 
 
612 bp  377  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4940    83.19 
 
 
460 bp  272  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4885    82.7 
 
 
368 bp  208  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3128    82.94 
 
 
478 bp  190  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.836092  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1094    82.65 
 
 
478 bp  182  8e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4934    82.65 
 
 
478 bp  182  8e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4928    82.65 
 
 
792 bp  182  8e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1691    82.65 
 
 
478 bp  182  8e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.074278  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3092    82.65 
 
 
478 bp  182  8e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4251    82.65 
 
 
562 bp  182  8e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4552    82.35 
 
 
792 bp  174  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1295    81.25 
 
 
499 bp  119  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00092664  normal  0.295207 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1083    83.25 
 
 
556 bp  117  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1082  hypothetical protein  86.26 
 
 
249 bp  117  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4914    83.25 
 
 
557 bp  117  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1395  hypothetical protein  84.47 
 
 
270 bp  117  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4916  hypothetical protein  85.71 
 
 
303 bp  83.8  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0061    81.25 
 
 
243 bp  63.9  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.063421 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1320    96.55 
 
 
574 bp  50.1  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.382216  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>