20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4896 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4940    98.49 
 
 
460 bp  856    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4896    100 
 
 
612 bp  1213    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1717  hypothetical protein  85.83 
 
 
750 bp  494  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0067    83.39 
 
 
636 bp  377  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.80103  normal  0.0650966 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1094    82.77 
 
 
478 bp  238  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1691    82.77 
 
 
478 bp  238  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.074278  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3092    82.77 
 
 
478 bp  238  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3128    82.77 
 
 
478 bp  238  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.836092  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4251    82.77 
 
 
562 bp  238  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4928    82.77 
 
 
792 bp  238  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4934    82.77 
 
 
478 bp  238  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4552    82.52 
 
 
792 bp  230  4e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1295    90.85 
 
 
499 bp  170  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00092664  normal  0.295207 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1082  hypothetical protein  85.07 
 
 
249 bp  161  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4885    81.53 
 
 
368 bp  159  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1395  hypothetical protein  86.71 
 
 
270 bp  147  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4916  hypothetical protein  84.52 
 
 
303 bp  127  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1083    83.51 
 
 
556 bp  123  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4914    83.51 
 
 
557 bp  123  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0061    78.28 
 
 
243 bp  52  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.063421 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>