21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4928 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4914    100 
 
 
557 bp  1104    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1083    99.82 
 
 
556 bp  1088    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1094    100 
 
 
478 bp  948    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4934    100 
 
 
478 bp  948    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4928    100 
 
 
792 bp  1570    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1691    100 
 
 
478 bp  948    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.074278  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3092    100 
 
 
478 bp  948    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4552    99.87 
 
 
792 bp  1562    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3128    99.79 
 
 
478 bp  940    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.836092  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4251    99.82 
 
 
562 bp  1100    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1082  hypothetical protein  100 
 
 
249 bp  494  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4916  hypothetical protein  100 
 
 
303 bp  391  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1717  hypothetical protein  82.88 
 
 
750 bp  341  1.9999999999999998e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3099    90.96 
 
 
216 bp  238  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4896    82.77 
 
 
612 bp  238  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0061    87.33 
 
 
243 bp  216  7e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.063421 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4940    82.04 
 
 
460 bp  204  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0067    82.65 
 
 
636 bp  182  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.80103  normal  0.0650966 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1395  hypothetical protein  86.45 
 
 
270 bp  141  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4885    80.99 
 
 
368 bp  139  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1295    78.98 
 
 
499 bp  115  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00092664  normal  0.295207 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>