17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1295 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1295    100 
 
 
499 bp  989    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00092664  normal  0.295207 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4885    91.89 
 
 
368 bp  430  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1717  hypothetical protein  82.17 
 
 
750 bp  170  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4896    90.85 
 
 
612 bp  170  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1083    79.1 
 
 
556 bp  123  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0067    81.25 
 
 
636 bp  119  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.80103  normal  0.0650966 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4928    78.98 
 
 
792 bp  115  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4914    78.98 
 
 
557 bp  115  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4552    78.98 
 
 
792 bp  115  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3099    87.13 
 
 
216 bp  97.6  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4251    80.86 
 
 
562 bp  97.6  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3128    81.65 
 
 
478 bp  83.8  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.836092  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4934    81.65 
 
 
478 bp  83.8  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3092    81.65 
 
 
478 bp  83.8  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1691    81.65 
 
 
478 bp  83.8  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.074278  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1094    81.65 
 
 
478 bp  83.8  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4940    95.56 
 
 
460 bp  65.9  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>