17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1490 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1490  hypothetical protein  100 
 
 
401 aa  768    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0156635  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0167  hypothetical protein  52.13 
 
 
419 aa  322  9.000000000000001e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5499  hypothetical protein  39.9 
 
 
408 aa  229  9e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.230554  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0537  hypothetical protein  39.71 
 
 
417 aa  220  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2872  hypothetical protein  38.08 
 
 
437 aa  192  8e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2803  hypothetical protein  37.25 
 
 
437 aa  189  7e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000161265  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3974  hypothetical protein  37.07 
 
 
474 aa  166  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0486  hypothetical protein  38.35 
 
 
436 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.864273  normal  0.0175213 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1081  hypothetical protein  36.67 
 
 
434 aa  153  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00809426  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03695  hypothetical protein  32.08 
 
 
434 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.977156  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0632  hypothetical protein  29.91 
 
 
430 aa  90.1  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.737364  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1181  hypothetical protein  28.02 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1075  hypothetical protein  35.71 
 
 
446 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0807571  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0303  DNA topoisomerase IV subunit A, contains toprim domain protein  24.64 
 
 
425 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0250  hypothetical protein  21.93 
 
 
422 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2245  hypothetical protein  21.29 
 
 
431 aa  69.3  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0383  hypothetical protein  25.96 
 
 
447 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>