14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0167 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0167  hypothetical protein  100 
 
 
419 aa  810    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1490  hypothetical protein  50.87 
 
 
401 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0156635  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5499  hypothetical protein  42.96 
 
 
408 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.230554  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2872  hypothetical protein  38.74 
 
 
437 aa  202  8e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2803  hypothetical protein  38.01 
 
 
437 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000161265  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3974  hypothetical protein  37.18 
 
 
474 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0537  hypothetical protein  33.82 
 
 
417 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0486  hypothetical protein  37.94 
 
 
436 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.864273  normal  0.0175213 
 
 
-
 
NC_003296  RS03695  hypothetical protein  33.01 
 
 
434 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.977156  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1081  hypothetical protein  33.75 
 
 
434 aa  107  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00809426  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0632  hypothetical protein  31.88 
 
 
430 aa  98.6  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.737364  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1075  hypothetical protein  35.56 
 
 
446 aa  70.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0807571  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0383  hypothetical protein  25.51 
 
 
447 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2245  hypothetical protein  19.53 
 
 
431 aa  66.6  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>