17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0537 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0537  hypothetical protein  100 
 
 
417 aa  833    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1490  hypothetical protein  39.95 
 
 
401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0156635  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3974  hypothetical protein  37.94 
 
 
474 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2872  hypothetical protein  33.98 
 
 
437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1081  hypothetical protein  37.26 
 
 
434 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00809426  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2803  hypothetical protein  33.74 
 
 
437 aa  184  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000161265  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03695  hypothetical protein  34.4 
 
 
434 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.977156  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5499  hypothetical protein  33.09 
 
 
408 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.230554  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0167  hypothetical protein  33.82 
 
 
419 aa  155  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0486  hypothetical protein  34.59 
 
 
436 aa  154  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.864273  normal  0.0175213 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2245  hypothetical protein  23.53 
 
 
431 aa  99.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0250  hypothetical protein  23.37 
 
 
422 aa  89  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1075  hypothetical protein  28.57 
 
 
446 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0807571  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1181  hypothetical protein  24.64 
 
 
406 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0632  hypothetical protein  26.74 
 
 
430 aa  81.3  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.737364  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0303  DNA topoisomerase IV subunit A, contains toprim domain protein  23.89 
 
 
425 aa  73.2  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0383  hypothetical protein  24.68 
 
 
447 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>