17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5499 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5499  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  817    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.230554  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0167  hypothetical protein  42.96 
 
 
419 aa  266  5.999999999999999e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1490  hypothetical protein  39.65 
 
 
401 aa  220  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0156635  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2803  hypothetical protein  35.27 
 
 
437 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000161265  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2872  hypothetical protein  34.72 
 
 
437 aa  188  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0537  hypothetical protein  32.85 
 
 
417 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03695  hypothetical protein  35.82 
 
 
434 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.977156  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3974  hypothetical protein  32.95 
 
 
474 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0486  hypothetical protein  35.73 
 
 
436 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.864273  normal  0.0175213 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1081  hypothetical protein  32.07 
 
 
434 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00809426  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2245  hypothetical protein  24.52 
 
 
431 aa  87  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0632  hypothetical protein  26.56 
 
 
430 aa  85.1  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.737364  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1181  hypothetical protein  25.68 
 
 
406 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0303  DNA topoisomerase IV subunit A, contains toprim domain protein  24.64 
 
 
425 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1075  hypothetical protein  31.3 
 
 
446 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0807571  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0250  hypothetical protein  19.95 
 
 
422 aa  52.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0383  hypothetical protein  25.89 
 
 
447 aa  46.2  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>