17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3974 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3974  hypothetical protein  100 
 
 		 474 aa  902    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1081  hypothetical protein  48.01 
 
 		 434 aa  276  5e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00809426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0486  hypothetical protein  44.16 
 
 		 436 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.864273  normal  0.0175213 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2872  hypothetical protein  40 
 
 		 437 aa  222  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2803  hypothetical protein  40 
 
 		 437 aa  222  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000161265  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03695  hypothetical protein  39.13 
 
 		 434 aa  210  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.977156  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0537  hypothetical protein  37.94 
 
 		 417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1490  hypothetical protein  37.07 
 
 		 401 aa  176  8e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0156635  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0167  hypothetical protein  37.88 
 
 		 419 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5499  hypothetical protein  33.79 
 
 		 408 aa  150  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.230554  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0632  hypothetical protein  30.88 
 
 		 430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.737364  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0250  hypothetical protein  24.52 
 
 		 422 aa  88.6  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2245  hypothetical protein  20.63 
 
 		 431 aa  72.4  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1075  hypothetical protein  28.75 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0807571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0303  DNA topoisomerase IV subunit A, contains toprim domain protein  25.82 
 
 		 425 aa  60.1  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1181  hypothetical protein  39.08 
 
 		 406 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0383  hypothetical protein  28.89 
 
 		 447 aa  50.8  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>