17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0383 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0383  hypothetical protein  100 
 
 
447 aa  914    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1181  hypothetical protein  41.42 
 
 
406 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0303  DNA topoisomerase IV subunit A, contains toprim domain protein  42.5 
 
 
425 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2245  hypothetical protein  34.42 
 
 
431 aa  240  5e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0250  hypothetical protein  28.34 
 
 
422 aa  157  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0632  hypothetical protein  28.73 
 
 
430 aa  120  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.737364  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2872  hypothetical protein  25.82 
 
 
437 aa  89.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2803  hypothetical protein  25.16 
 
 
437 aa  85.9  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000161265  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0167  hypothetical protein  25.97 
 
 
419 aa  73.2  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2036  serine/threonine protein kinase  26.12 
 
 
709 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0537  hypothetical protein  24.68 
 
 
417 aa  70.5  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03695  hypothetical protein  35.25 
 
 
434 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.977156  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1081  hypothetical protein  26.38 
 
 
434 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00809426  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1490  hypothetical protein  25.06 
 
 
401 aa  61.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0156635  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0486  hypothetical protein  29.47 
 
 
436 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.864273  normal  0.0175213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3974  hypothetical protein  29.26 
 
 
474 aa  50.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5499  hypothetical protein  25.89 
 
 
408 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.230554  normal  0.022722 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>