14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2332 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2332    100 
 
 
932 bp  1848    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.972617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  84.93 
 
 
933 bp  58  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  94.44 
 
 
960 bp  56  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
939 bp  56  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  92.11 
 
 
963 bp  52  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  90.24 
 
 
942 bp  50.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4016  hypothetical protein  100 
 
 
525 bp  48.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.989506  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1718  protease Do  96.43 
 
 
1416 bp  48.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759509  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  100 
 
 
1824 bp  48.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  100 
 
 
1824 bp  48.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0470  protease Do  96.43 
 
 
1416 bp  48.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102018  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  88.64 
 
 
969 bp  48.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2284  sulfatase  96.43 
 
 
2355 bp  48.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4597    96.43 
 
 
804 bp  48.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00166629  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>