12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4597 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4597    100 
 
 		 804 bp  1594    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00166629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  92.86 
 
 		 954 bp  60  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  89.8 
 
 		 939 bp  58  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  92.5 
 
 		 912 bp  56  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6323  ribokinase family sugar kinase  96.77 
 
 		 909 bp  54  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05325  sugar kinase protein  90.24 
 
 		 924 bp  50.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  96.55 
 
 		 921 bp  50.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0537  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  96.43 
 
 		 483 bp  48.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4541  cyclic nucleotide-binding protein  96.43 
 
 		 1281 bp  48.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4508  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 1071 bp  48.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0198  PfkB domain protein  90 
 
 		 933 bp  48.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2332    96.43 
 
 		 932 bp  48.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.972617 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>