15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1930 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1930  putative oxidase  100 
 
 		 232 aa  471  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.310424 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2564  alternative oxidase  63.94 
 
 		 214 aa  282  3.0000000000000004e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.592262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1660  Alternative oxidase  61.24 
 
 		 209 aa  275  3e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1576  alternative oxidase  58.29 
 
 		 229 aa  258  4e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0387907  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5295  alternative oxidase  58.71 
 
 		 229 aa  251  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.736306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00951  hypothetical protein  55.21 
 
 		 211 aa  233  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0677  hypothetical protein  54.69 
 
 		 212 aa  229  4e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.208284  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3395  alternative oxidase  52.06 
 
 		 211 aa  223  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.684782  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01500  alternative oxidase 1  53.29 
 
 		 401 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02099  Alternative oxidase, mitochondrial Precursor (EC 1.-.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9P959]  43.93 
 
 		 354 aa  182  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.168616  normal  0.300538 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4977  predicted protein  46.08 
 
 		 221 aa  182  3e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_4970  predicted protein  46.08 
 
 		 221 aa  182  3e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67332  Alternative oxidase, mitochondrial precursor (SHAM-sensitive terminal oxidase) (STO1)  39.73 
 
 		 357 aa  170  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.537821  normal  0.0955633 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1055  alternative oxidase  26.46 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000214827  hitchhiker  0.0000989196 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48063  predicted protein  25.4 
 
 		 314 aa  43.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>