15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_67332 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_67332  Alternative oxidase, mitochondrial precursor (SHAM-sensitive terminal oxidase) (STO1)  100 
 
 
357 aa  746    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.537821  normal  0.0955633 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02099  Alternative oxidase, mitochondrial Precursor (EC 1.-.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9P959]  51.81 
 
 
354 aa  293  3e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.168616  normal  0.300538 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01500  alternative oxidase 1  48.13 
 
 
401 aa  251  1e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4977  predicted protein  45.76 
 
 
221 aa  209  7e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_4970  predicted protein  45.76 
 
 
221 aa  209  7e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1660  Alternative oxidase  48.81 
 
 
209 aa  173  5e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2564  alternative oxidase  40.09 
 
 
214 aa  171  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.592262  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1930  putative oxidase  39.73 
 
 
232 aa  170  4e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.310424 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5295  alternative oxidase  50.92 
 
 
229 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.736306  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1576  alternative oxidase  50.92 
 
 
229 aa  165  9e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0387907  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00951  hypothetical protein  46.71 
 
 
211 aa  161  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3395  alternative oxidase  43.71 
 
 
211 aa  160  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.684782  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0677  hypothetical protein  44.25 
 
 
212 aa  159  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.208284  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41170  predicted protein  30.3 
 
 
531 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0989203  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1055  alternative oxidase  26.19 
 
 
228 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000214827  hitchhiker  0.0000989196 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>