18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3395 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_3395  alternative oxidase  100 
 
 
211 aa  441  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.684782  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0677  hypothetical protein  75.83 
 
 
212 aa  348  3e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.208284  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00951  hypothetical protein  75.24 
 
 
211 aa  343  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2564  alternative oxidase  55.88 
 
 
214 aa  245  3e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.592262  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5295  alternative oxidase  54.5 
 
 
229 aa  237  9e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.736306  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1576  alternative oxidase  54.5 
 
 
229 aa  234  7e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0387907  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1660  Alternative oxidase  50.52 
 
 
209 aa  230  9e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1930  putative oxidase  52.06 
 
 
232 aa  223  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.310424 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4977  predicted protein  40 
 
 
221 aa  171  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_4970  predicted protein  40 
 
 
221 aa  171  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02099  Alternative oxidase, mitochondrial Precursor (EC 1.-.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9P959]  37.1 
 
 
354 aa  164  8e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.168616  normal  0.300538 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01500  alternative oxidase 1  41.75 
 
 
401 aa  162  3e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67332  Alternative oxidase, mitochondrial precursor (SHAM-sensitive terminal oxidase) (STO1)  43.71 
 
 
357 aa  160  1e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.537821  normal  0.0955633 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1055  alternative oxidase  27.96 
 
 
228 aa  62  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000214827  hitchhiker  0.0000989196 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_10319  predicted protein  24.63 
 
 
240 aa  46.6  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0970285  normal  0.563011 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0439  plastoquinol terminal oxidase  27.94 
 
 
207 aa  44.7  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0881752  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41170  predicted protein  27.7 
 
 
531 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0989203  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48063  predicted protein  28.57 
 
 
314 aa  41.6  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>