17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1660 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1660  Alternative oxidase  100 
 
 
209 aa  428  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1930  putative oxidase  61.24 
 
 
232 aa  275  3e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.310424 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2564  alternative oxidase  61.06 
 
 
214 aa  275  3e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.592262  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5295  alternative oxidase  64.32 
 
 
229 aa  273  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.736306  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1576  alternative oxidase  64.65 
 
 
229 aa  269  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0387907  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00951  hypothetical protein  54.04 
 
 
211 aa  242  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3395  alternative oxidase  50.52 
 
 
211 aa  230  9e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.684782  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0677  hypothetical protein  52.33 
 
 
212 aa  229  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.208284  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01500  alternative oxidase 1  53.8 
 
 
401 aa  198  6e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02099  Alternative oxidase, mitochondrial Precursor (EC 1.-.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9P959]  46.51 
 
 
354 aa  196  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.168616  normal  0.300538 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_4970  predicted protein  46.6 
 
 
221 aa  184  7e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4977  predicted protein  46.6 
 
 
221 aa  184  7e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67332  Alternative oxidase, mitochondrial precursor (SHAM-sensitive terminal oxidase) (STO1)  48.81 
 
 
357 aa  173  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.537821  normal  0.0955633 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1055  alternative oxidase  27.75 
 
 
228 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000214827  hitchhiker  0.0000989196 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5300  predicted protein  26.42 
 
 
245 aa  51.6  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.025079 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48063  predicted protein  26.6 
 
 
314 aa  51.2  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41170  predicted protein  28.19 
 
 
531 aa  48.5  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0989203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>